I have a vector of values (generated from a raster - Raster package - by the clump function in R):
values(rc)
1 NA NA NA 2 NA 2 2 NA NA NA NA NA NA NA 2 NA 2 2 NA 2 2 NA NA NA
NA NA NA NA 2 NA NA NA NA NA 3 NA 4 NA 2 NA 2 NA 5 NA NA 3 NA NA 4
NA NA 2 NA NA NA NA NA NA NA NA 4 NA NA NA NA NA NA 6 NA 7 NA 4 NA NA
NA 8 8 NA 6 6 NA NA NA NA 4 NA NA NA NA NA NA NA NA 4 4 4 NA NA 9
NA NA NA NA 10 NA NA NA NA 4 NA 9 9 NA NA NA NA 10 NA NA NA 4 NA NA NA
9 NA NA NA NA NA NA NA NA NA 11 NA NA NA 12 NA NA NA NA
and I would like to find every value that happens only once (so 1,5,11,10) and replace it with NA . What I would like to receive:
values(replaced_rc)
NA NA NA NA 2 NA 2 2 NA NA NA NA NA NA NA 2 NA 2 2 NA 2 2 NA NA NA
NA NA NA NA 2 NA NA NA NA NA 3 NA 4 NA 2 NA 2 NA NA NA NA 3 NA NA 4
NA NA 2 NA NA NA NA NA NA NA NA 4 NA NA NA NA NA NA 6 NA NA NA 4 NA NA
NA 8 8 NA 6 6 NA NA NA NA 4 NA NA NA NA NA NA NA NA 4 4 4 NA NA 9
NA NA NA NA 10 NA NA NA NA 4 NA 9 9 NA NA NA NA 10 NA NA NA 4 NA NA NA
9 NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA NA
The problem is that I can easily identify raster patches using the clump function . And I would like to exclude corrections containing only a pixel, similar to the sieve function in ENVI or ERDAS. Any help? Thank you very much in advance.
Example from R:
library("raster")
r <- raster(ncols=12, nrows=12)
set.seed(0)
r[] <- round(runif(ncell(r))*0.7 )
plot(r)
rc <- clump(r)
replaced_rc<- ???